Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Rtf1A2AQ19 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Rtf1A2AQ19 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
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Rtf1A2AQ19 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
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Rtf1A2AQ19 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Rtf1A2AQ19 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Rtf1A2AQ19 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Rtf1A2AQ19 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Rtf1A2AQ19 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rtf1A2AQ19 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms