Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

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Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Gm17190V9GX38 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm17190V9GX38 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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