Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Homer1Q9Z2Y3 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms