Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Sfrp4Q9Z1N6 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Sfrp4Q9Z1N6 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms