Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU28

Pfdn5, Prefoldin subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn5Q9WU28 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Pfdn5Q9WU28 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfdn5Q9WU28 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfdn5Q9WU28 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfdn5Q9WU28 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfdn5Q9WU28 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfdn5Q9WU28 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfdn5Q9WU28 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfdn5Q9WU28 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfdn5Q9WU28 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfdn5Q9WU28 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfdn5Q9WU28 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfdn5Q9WU28 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfdn5Q9WU28 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfdn5Q9WU28 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfdn5Q9WU28 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfdn5Q9WU28 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfdn5Q9WU28 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfdn5Q9WU28 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfdn5Q9WU28 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfdn5Q9WU28 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfdn5Q9WU28 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Pfdn5Q9WU28 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms