Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Psmb3Q9R1P1 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Psmb3Q9R1P1 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms