Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gpc6Q9R087 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gpc6Q9R087 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms