Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ercc4Q9QZD4 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms