Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ubxn8Q9QZ49 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms