Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sfmbt1Q9JMD1 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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