Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
CubnQ9JLB4 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms