Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gde1Q9JL56 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gde1Q9JL56 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms