Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
OtofQ9ESF1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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