Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trim54Q9ERP3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim54Q9ERP3 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms