Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAX3

Erv3, Endogenous retroviral sequence 3, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erv3Q9DAX3 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Erv3Q9DAX3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Erv3Q9DAX3 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms