Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9S1

UPF0193 protein EVG1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9S1 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D9S1 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D9S1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D9S1 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D9S1 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D9S1 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D9S1 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms