Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Klhl40Q9D783 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Klhl40Q9D783 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms