Protein–RNA interactions for Protein: Q9D350

Obox1, OBOX1, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox1Q9D350 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Obox1Q9D350 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.9 ms