Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Trappc6bQ9D289 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Trappc6bQ9D289 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Trappc6bQ9D289 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Trappc6bQ9D289 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trappc6bQ9D289 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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