Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms