Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc47Q9D024 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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