Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
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Sgo1Q9CXH7 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
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Sgo1Q9CXH7 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
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Sgo1Q9CXH7 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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Sgo1Q9CXH7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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Sgo1Q9CXH7 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
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Sgo1Q9CXH7 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Sgo1Q9CXH7 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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