Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Xrcc3Q9CXE6 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Xrcc3Q9CXE6 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Xrcc3Q9CXE6 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Xrcc3Q9CXE6 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Xrcc3Q9CXE6 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
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Xrcc3Q9CXE6 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Xrcc3Q9CXE6 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Xrcc3Q9CXE6 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Xrcc3Q9CXE6 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Xrcc3Q9CXE6 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Xrcc3Q9CXE6 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Xrcc3Q9CXE6 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Xrcc3Q9CXE6 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Xrcc3Q9CXE6 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Xrcc3Q9CXE6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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