Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX97

Wdr55, WD repeat-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr55Q9CX97 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Wdr55Q9CX97 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms