Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Cnih4Q9CX13 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Cnih4Q9CX13 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
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