Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Utp23Q9CX11 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Utp23Q9CX11 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms