Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Pard3bQ9CSB4 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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