Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS8

Sec61b, Protein transport protein Sec61 subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 96 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec61bQ9CQS8 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Csnk1a1-208ENSMUST00000167187 1222 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Obox1-206ENSMUST00000181001 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Gm38170-201ENSMUST00000195404 816 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Gm26670-201ENSMUST00000180429 3287 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Olfr282-203ENSMUST00000213608 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Sec61bQ9CQS8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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