Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ndufb9Q9CQJ8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms