Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF0

Mrpl11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl11Q9CQF0 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl11Q9CQF0 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms