Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Nudcd2Q9CQ48 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms