Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ45

Nenf, Neudesin, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NenfQ9CQ45 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NenfQ9CQ45 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms