Protein–RNA interactions for Protein: Q99P87

Retn, Resistin, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RetnQ99P87 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
RetnQ99P87 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RetnQ99P87 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RetnQ99P87 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RetnQ99P87 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RetnQ99P87 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RetnQ99P87 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RetnQ99P87 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RetnQ99P87 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RetnQ99P87 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
RetnQ99P87 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RetnQ99P87 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RetnQ99P87 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RetnQ99P87 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
RetnQ99P87 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
RetnQ99P87 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RetnQ99P87 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RetnQ99P87 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RetnQ99P87 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
RetnQ99P87 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
RetnQ99P87 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
RetnQ99P87 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms