Protein–RNA interactions for Protein: Q99P51

Rassf3, Ras association domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf3Q99P51 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rassf3Q99P51 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms