Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE9

Pbx4, Pre-B-cell leukemia transcription factor 4, mousemouse

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Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbx4Q99NE9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Pbx4Q99NE9 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Pbx4Q99NE9 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Pbx4Q99NE9 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Pbx4Q99NE9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Pbx4Q99NE9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Pbx4Q99NE9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Pbx4Q99NE9 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Pbx4Q99NE9 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pbx4Q99NE9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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