Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hdac9Q99N13 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms