Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pramel1Q99MW3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms