Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB1

Tlr3, Toll-like receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr3Q99MB1 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tlr3Q99MB1 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr3Q99MB1 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr3Q99MB1 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr3Q99MB1 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr3Q99MB1 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr3Q99MB1 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr3Q99MB1 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr3Q99MB1 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr3Q99MB1 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr3Q99MB1 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr3Q99MB1 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr3Q99MB1 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr3Q99MB1 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr3Q99MB1 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr3Q99MB1 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr3Q99MB1 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr3Q99MB1 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr3Q99MB1 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr3Q99MB1 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr3Q99MB1 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr3Q99MB1 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr3Q99MB1 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr3Q99MB1 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr3Q99MB1 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr3Q99MB1 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr3Q99MB1 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr3Q99MB1 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr3Q99MB1 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr3Q99MB1 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr3Q99MB1 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr3Q99MB1 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr3Q99MB1 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr3Q99MB1 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr3Q99MB1 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr3Q99MB1 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr3Q99MB1 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr3Q99MB1 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr3Q99MB1 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr3Q99MB1 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr3Q99MB1 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr3Q99MB1 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr3Q99MB1 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr3Q99MB1 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tlr3Q99MB1 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tlr3Q99MB1 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tlr3Q99MB1 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tlr3Q99MB1 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tlr3Q99MB1 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tlr3Q99MB1 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tlr3Q99MB1 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tlr3Q99MB1 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tlr3Q99MB1 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms