Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ciao1Q99KN2 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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