Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

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Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp11Q99K46 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp11Q99K46 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp11Q99K46 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp11Q99K46 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp11Q99K46 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp11Q99K46 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp11Q99K46 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp11Q99K46 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Usp11Q99K46 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp11Q99K46 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp11Q99K46 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp11Q99K46 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp11Q99K46 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp11Q99K46 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp11Q99K46 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp11Q99K46 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp11Q99K46 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp11Q99K46 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp11Q99K46 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp11Q99K46 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp11Q99K46 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp11Q99K46 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp11Q99K46 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp11Q99K46 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp11Q99K46 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp11Q99K46 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Usp11Q99K46 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Usp11Q99K46 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Usp11Q99K46 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp11Q99K46 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Usp11Q99K46 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Usp11Q99K46 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Usp11Q99K46 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp11Q99K46 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp11Q99K46 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Usp11Q99K46 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Usp11Q99K46 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Usp11Q99K46 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Usp11Q99K46 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp11Q99K46 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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