Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smim11aQ99J19 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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