Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn16Q925N4 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
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Cldn16Q925N4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
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Cldn16Q925N4 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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Cldn16Q925N4 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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Cldn16Q925N4 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
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Cldn16Q925N4 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Cldn16Q925N4 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Cldn16Q925N4 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Cldn16Q925N4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Cldn16Q925N4 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Cldn16Q925N4 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Cldn16Q925N4 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn16Q925N4 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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