Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csmd1Q923L3 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms