Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim59Q922Y2 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms