Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clip1Q922J3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clip1Q922J3 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms