Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tubb6Q922F4 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms