Protein–RNA interactions for Protein: Q920F6

Smc1b, Structural maintenance of chromosomes protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1bQ920F6 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Smc1bQ920F6 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smc1bQ920F6 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smc1bQ920F6 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smc1bQ920F6 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Smc1bQ920F6 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smc1bQ920F6 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smc1bQ920F6 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smc1bQ920F6 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smc1bQ920F6 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smc1bQ920F6 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Smc1bQ920F6 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Smc1bQ920F6 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Smc1bQ920F6 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Smc1bQ920F6 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Smc1bQ920F6 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Smc1bQ920F6 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Smc1bQ920F6 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Smc1bQ920F6 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Smc1bQ920F6 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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