Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vps4aQ8VEJ9 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vps4aQ8VEJ9 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vps4aQ8VEJ9 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vps4aQ8VEJ9 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vps4aQ8VEJ9 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vps4aQ8VEJ9 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vps4aQ8VEJ9 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vps4aQ8VEJ9 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vps4aQ8VEJ9 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vps4aQ8VEJ9 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Vps4aQ8VEJ9 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vps4aQ8VEJ9 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vps4aQ8VEJ9 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vps4aQ8VEJ9 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vps4aQ8VEJ9 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vps4aQ8VEJ9 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vps4aQ8VEJ9 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vps4aQ8VEJ9 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vps4aQ8VEJ9 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vps4aQ8VEJ9 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vps4aQ8VEJ9 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vps4aQ8VEJ9 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vps4aQ8VEJ9 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vps4aQ8VEJ9 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vps4aQ8VEJ9 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vps4aQ8VEJ9 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vps4aQ8VEJ9 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vps4aQ8VEJ9 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vps4aQ8VEJ9 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vps4aQ8VEJ9 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vps4aQ8VEJ9 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vps4aQ8VEJ9 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vps4aQ8VEJ9 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vps4aQ8VEJ9 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vps4aQ8VEJ9 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vps4aQ8VEJ9 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vps4aQ8VEJ9 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vps4aQ8VEJ9 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vps4aQ8VEJ9 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vps4aQ8VEJ9 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vps4aQ8VEJ9 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vps4aQ8VEJ9 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vps4aQ8VEJ9 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vps4aQ8VEJ9 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vps4aQ8VEJ9 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vps4aQ8VEJ9 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Vps4aQ8VEJ9 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vps4aQ8VEJ9 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vps4aQ8VEJ9 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vps4aQ8VEJ9 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vps4aQ8VEJ9 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vps4aQ8VEJ9 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vps4aQ8VEJ9 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vps4aQ8VEJ9 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vps4aQ8VEJ9 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms