Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smg8Q8VE18 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Smg8Q8VE18 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Smg8Q8VE18 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Smg8Q8VE18 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Smg8Q8VE18 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Smg8Q8VE18 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Smg8Q8VE18 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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