Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Stx18Q8VDS8 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms